Moleculaire epidemiologie

In dit boek hebben we de prevalentie van verschillende serotypes, fylogenetische groepen, antibioticaresistentie, antibioticaresistentiegenen (ARG's) en extra-intestinale virulentiegenen van Escherichia coli isolaten uit een tropisch estuarium aan de zuidwestkust van India onderzocht. In totaal werden 300 E. coli stammen geïsoleerd uit vijf verschillende stations in het Cochin estuarium gedurende een periode van juni 2009 tot februari 2013. In totaal werden 225 watermonsters geanalyseerd op fecale coliformen volgens de MPN-methode. Biochemisch bevestigde E. coli-culturen werden geserotypeerd in het National Salmonella and Escherichia Center, Central Research Institute, Kasauli, Himachal Pradesh, India. De moleculaire identificatie van E. coli werd gedaan door de versterking van het uidA-gen. Fylogenetische groepering van E. coli isolaten werd bepaald door een triplex PCR-methode. De prevalentie van antibioticaresistentie onder E. coli isolaten werd bepaald door middel van de schijfdiffusiemethode en meervoudige antibioticaresistentie (MAR) indexering. Kunstmatige intelligentie werd gebruikt om dit boek te vertalen.